Dopo aver concluso la Conferenza di Yalta nel febbraio del 1945, i leader dei "tre grandi" alleati, Franklin Roosevelt (Stati Uniti), Winston Churchill (Gran Bretagna) e Joseph Stalin (URSS) accettarono di incontrarsi nuovamente dopo la vittoria in Europa per determinare i confini del dopoguerra, negoziare i trattati e risolvere i problemi relativi alla gestione della Germania. Questo incontro programmato doveva essere il loro terzo incontro, il primo dopo la conferenza di Teheran del novembre 1943. Con la resa tedesca l'8 maggio, i leader hanno programmato una conferenza nella città tedesca di Potsdam per luglio.
Il 12 aprile Roosevelt morì e il vicepresidente Harry S. Truman salì alla presidenza. Sebbene sia un neofita relativo negli affari esteri, Truman era significativamente più diffidente nei confronti dei motivi e dei desideri di Stalin nell'Europa orientale rispetto al suo predecessore. In partenza per Potsdam con il segretario di stato James Byrnes, Truman sperava di invertire alcune concessioni che Roosevelt aveva dato a Stalin in nome del mantenimento dell'unità degli alleati durante la guerra. Incontro allo Schloss Cecilienhof, i colloqui sono iniziati il 17 luglio. Presiedendo la conferenza, Truman è stato inizialmente aiutato dall'esperienza di Churchill nel trattare con Stalin.
Ciò si interruppe bruscamente il 26 luglio, quando il Partito conservatore di Churchill fu incredibilmente sconfitto alle elezioni generali del 1945. Tenuto il 5 luglio, l'annuncio dei risultati è stato ritardato al fine di contare con precisione i voti provenienti dalle forze britanniche che prestano servizio all'estero. Con la sconfitta di Churchill, il leader britannico in tempo di guerra fu sostituito dal primo ministro entrante Clement Attlee e dal nuovo segretario agli Esteri Ernest Bevin. Mancando la vasta esperienza e lo spirito indipendente di Churchill, Attlee ha spesso rinviato a Truman durante le ultime fasi dei colloqui.
All'inizio della conferenza, Truman venne a sapere del Trinity Test nel New Mexico che segnalò il completamento con successo del Progetto Manhattan e la creazione della prima bomba atomica. Condividendo queste informazioni con Stalin il 24 luglio, sperava che l'esistenza della nuova arma avrebbe rafforzato la sua mano nel trattare con il leader sovietico. Questo nuovo non riuscì a impressionare Stalin quando aveva appreso del Progetto Manhattan attraverso la sua rete di spie ed era consapevole dei suoi progressi.
All'inizio dei colloqui, i leader hanno confermato che la Germania e l'Austria sarebbero state divise in quattro zone di occupazione. Continuando, Truman cercò di mitigare la richiesta dell'Unione Sovietica di pesanti riparazioni dalla Germania. Credendo che le gravi riparazioni imposte dal Trattato di Versailles del primo dopoguerra avessero paralizzato l'economia tedesca alla guida dell'ascesa dei nazisti, Truman lavorò per limitare le riparazioni di guerra. Dopo estesi negoziati, fu concordato che le riparazioni sovietiche sarebbero state confinate nella loro zona di occupazione e nel 10% della capacità industriale in eccesso dell'altra zona.
I leader hanno anche convenuto che la Germania dovrebbe essere smilitarizzata, identificata e che tutti i criminali di guerra dovrebbero essere perseguiti. Per raggiungere il primo di questi, le industrie associate alla creazione di materiale bellico furono eliminate o ridotte con la nuova economia tedesca per essere basate sull'agricoltura e sulla produzione interna. Tra le decisioni controverse da prendere a Potsdam c'erano quelle relative alla Polonia. Come parte dei colloqui di Potsdam, gli Stati Uniti e la Gran Bretagna accettarono di riconoscere il governo provvisorio di unità nazionale sostenuto dall'Unione Sovietica piuttosto che il governo polacco in esilio che aveva sede a Londra dal 1939.
Inoltre, Truman accettò con riluttanza di aderire alle richieste sovietiche che il nuovo confine occidentale della Polonia si trovasse lungo la linea Oder-Neisse. L'uso di questi fiumi per indicare il nuovo confine ha visto la Germania perdere quasi un quarto del suo territorio prebellico con la maggior parte destinata alla Polonia e gran parte della Prussia orientale ai sovietici. Sebbene Bevin abbia discusso contro la Linea Oder-Neisse, Truman ha effettivamente scambiato questo territorio per ottenere concessioni sulla questione delle riparazioni. Il trasferimento di questo territorio portò allo sfollamento di un gran numero di etnici tedeschi e rimase controverso per decenni.
Oltre a questi problemi, la Conferenza di Potsdam ha visto gli Alleati concordare sulla formazione di un Consiglio dei Ministri degli Esteri che avrebbe preparato trattati di pace con gli ex alleati della Germania. I leader alleati accettarono anche di rivedere la Convenzione di Montreux del 1936, che garantiva alla Turchia il controllo esclusivo dello stretto turco, che gli Stati Uniti e la Gran Bretagna avrebbero determinato il governo austriaco e che l'Austria non avrebbe pagato le riparazioni. I risultati della Conferenza di Potsdam sono stati formalmente presentati nell'Accordo di Potsdam che è stato emesso alla fine della riunione il 2 agosto.
Il 26 luglio, durante la Conferenza di Potsdam, Churchill, Truman e il leader nazionalista cinese Chiang Kai-Shek hanno emesso la Dichiarazione di Potsdam che delineava i termini della resa per il Giappone. Ribadendo la richiesta di resa incondizionata, la Dichiarazione stabiliva che la sovranità giapponese doveva essere limitata alle isole di origine, che i criminali di guerra sarebbero stati perseguiti, che il governo autoritario sarebbe finito, i militari sarebbero stati disarmati e che ne sarebbe seguita un'occupazione. Nonostante questi termini, ha anche sottolineato che gli Alleati non hanno cercato di distruggere i giapponesi come popolo.
Il Giappone ha rifiutato questi termini nonostante una minaccia alleata che ne conseguirebbe "una distruzione rapida e totale". Reagendo ai giapponesi, Truman ordinò di usare la bomba atomica. L'uso della nuova arma su Hiroshima (6 agosto) e Nagasaki (9 agosto) alla fine portò alla resa del Giappone il 2 settembre. Partendo da Potsdam, i leader alleati non si sarebbero più incontrati. La brina delle relazioni tra Stati Uniti e Unione Sovietica, iniziata durante la conferenza, si è intensificata durante la Guerra Fredda.