Quando il commodoro Matthew Perry e le navi nere americane si presentarono a Edo Harbour, il loro aspetto e la successiva "apertura" del Giappone scatenarono una catena imprevedibile di eventi a Tokugawa in Giappone, a capo di loro una guerra civile scoppiata quindici anni dopo: il Boshin Guerra.
La guerra di Boshin durò solo due anni, tra il 1868 e il 1869, e contrappose samurai e nobili giapponesi al regime regnante di Tokugawa, in cui il samurai voleva rovesciare lo shogun e restituire potere politico all'imperatore.
Alla fine, il militante pro-imperatore samurai di Satsuma e Choshu convinse l'imperatore a emanare un decreto che dissolveva la Casa di Tokugawa, un colpo potenzialmente fatale per la famiglia degli ex shogun.
Il 27 gennaio 1868, l'esercito dello shogunato, che contava più di 15.000 e principalmente composto da samurai tradizionali, attaccò le truppe di Satsuma e Choshu all'ingresso meridionale di Kyoto, la capitale imperiale.
Choshu e Satsuma avevano solo 5.000 truppe nel combattimento, ma avevano armi moderne tra cui fucili, proiettili e persino pistole Gatling. Quando le truppe pro-imperiali vinsero il combattimento di due giorni, diversi importanti daimyo cambiarono fedeltà dallo shogun all'imperatore.
Il 7 febbraio, l'ex shogun Tokugawa Yoshinobu lasciò Osaka e si ritirò nella sua capitale, Edo (Tokyo). Scoraggiato dal suo volo, le forze shogunali rinunciarono alla difesa del castello di Osaka, che cadde nelle forze imperiali il giorno seguente.
In un altro colpo allo shogun, i ministri degli esteri delle potenze occidentali decisero all'inizio di febbraio di riconoscere il governo dell'imperatore come legittimo governo del Giappone. Tuttavia, ciò non ha impedito ai samurai della parte imperiale di attaccare gli stranieri in diversi episodi separati poiché il sentimento anti-straniero era molto alto.
Saigo Takamori, in seguito famoso come "L'ultimo samurai", guidò le truppe dell'imperatore in tutto il Giappone per circondare Edo nel maggio del 1869 e la capitale dello shogun si arrese incondizionatamente poco tempo dopo.
Nonostante questa apparentemente rapida sconfitta delle forze dello shogunal, il comandante della marina dello shogun si rifiutò di arrendersi otto delle sue navi, invece di dirigersi a nord, sperando di unire le forze con il samurai del clan Aizu e altri guerrieri del dominio settentrionale, che erano ancora fedeli al governo shogunal.
La coalizione del Nord era coraggiosa, ma si basava su metodi di combattimento e armi tradizionali. Ci vollero le truppe imperiali ben armate da maggio a novembre del 1869 per sconfiggere finalmente la testarda resistenza del nord, ma il 6 novembre l'ultimo samurai di Aizu si arrese.
Due settimane prima, il periodo Meiji era ufficialmente iniziato e l'ex capitale shogunale di Edo era stata ribattezzata Tokyo, che significa "capitale orientale".
Sebbene la guerra di Boshin fosse finita, le conseguenze di questa serie di eventi continuarono. Gli irriducibili della coalizione del Nord, così come alcuni consiglieri militari francesi, tentarono di fondare la Repubblica Ezo separata sull'isola settentrionale di Hokkaido, ma la repubblica di breve durata si arrese e fece l'occhiolino dal 27 giugno 1869.
In una svolta interessante, Saigo Takamori del dominio pro-Meiji Satsuma in seguito si è pentito del suo ruolo nella Restaurazione Meiji. Alla fine fu investito da un ruolo di guida nella condannata ribellione di Satsuma, che terminò nel 1877 con la sua morte.