Gli ugonotti erano calvinisti francesi, attivi principalmente nel XVI secolo. Furono perseguitati dalla Francia cattolica e circa 300.000 ugonotti fuggirono dalla Francia per l'Inghilterra, l'Olanda, la Svizzera, la Prussia e le colonie olandesi e inglesi nelle Americhe.
La battaglia tra ugonotti e cattolici in Francia rifletteva anche lotte tra case nobili.
In America, il termine ugonotto veniva anche applicato ai protestanti di lingua francese, in particolare ai calvinisti, di altri paesi, tra cui Svizzera e Belgio. Molti valloni (un gruppo etnico del Belgio e parte della Francia) erano calvinisti.
La fonte del nome "ugonotto" non è nota.
In Francia, stato e corona nel 16esimo secolo sono stati allineati con la Chiesa cattolica romana. Vi fu poca influenza sulla riforma di Lutero, ma le idee di John Calvin arrivarono in Francia e portarono la Riforma in quel paese. Nessuna provincia e poche città divennero esplicitamente protestanti, ma le idee di Calvino, le nuove traduzioni della Bibbia e l'organizzazione delle congregazioni si diffusero abbastanza rapidamente. Calvino stimò che entro la metà del 16esimo secolo, 300.000 francesi erano diventati seguaci della sua religione Riformata. Secondo i cattolici, i calvinisti in Francia si stavano organizzando per prendere il potere in una rivoluzione armata.
Il duca di Guise e suo fratello, il cardinale di Lorena, erano particolarmente odiati, e non solo dagli ugonotti. Entrambi erano noti per mantenere il potere con qualsiasi mezzo, incluso l'assassinio.
Caterina dei Medici, una regina francese di origine italiana consorte che divenne reggente per suo figlio Carlo IX quando il suo primo figlio morì giovane, si oppose alla nascita della religione riformata.
Il 1 ° marzo 1562, le truppe francesi massacrarono gli ugonotti in adorazione e altri cittadini ugonotti a Wassy, in Francia, in quello che è noto come il massacro di Wassy (o Vassy). Francesco, duca di Guise, ordinò il massacro, secondo quanto riferito dopo essersi fermato a Wassy per partecipare a una messa e aver trovato un gruppo di ugonotti che veneravano in un fienile. Le truppe hanno ucciso 63 ugonotti, tutti disarmati e incapaci di difendersi. Oltre un centinaio di ugonotti sono rimasti feriti. Ciò portò allo scoppio della prima di numerose guerre civili in Francia note come Guerre di religione francesi, che durarono più di cento anni.
Jeanne d'Albret (Jeanne di Navarra) era uno dei leader del partito ugonotto. Figlia di Marguerite di Navarra, era anche istruita. Era una cugina del re francese Enrico III, e prima era stata sposata con il duca di Cleves, poi, quando quel matrimonio fu annullato, con Antoine de Bourbon. Antoine era in linea di successione se la casa al potere di Valois non produceva eredi al trono francese. Jeanne divenne sovrana della Navarra quando suo padre morì nel 1555, e Antoine il sovrano consorte. Nel Natale del 1560, Jeanne annunciò la sua conversione al protestantesimo calvinista.
Giovanna di Navarra, dopo il massacro di Wassy, divenne più ferventemente protestante, e lei e Antoine litigarono per sapere se il loro figlio sarebbe cresciuto come cattolico o protestante. Quando minacciò il divorzio, Antoine fece mandare il figlio alla corte di Caterina de 'Medici.
A Vendome gli ugonotti si ribellarono e attaccarono la chiesa romana locale e le tombe borboniche. Papa Clemente, papa di Avignone nel 14esimo secolo, era stato sepolto in un'abbazia di La Chaise-Dieu. Durante i combattimenti nel 1562 tra ugonotti e cattolici, alcuni ugonotti dissotterrarono i suoi resti e li bruciarono.
Antoine di Navarra (Antoine de Bourbon) stava combattendo per la corona e dalla parte cattolica a Rouen quando fu ucciso a Rouen, dove un assedio durò da maggio a ottobre del 1562. Un'altra battaglia a Dreux portò alla cattura di un leader di gli ugonotti, Louis de Bourbon, principe di Condé.
Il 19 marzo 1563 fu firmato un trattato di pace, la Pace di Amboise.
In Navarra, Jeanne cercò di istituire la tolleranza religiosa, ma si ritrovò sempre più a opporsi alla famiglia Guise. Filippo di Spagna ha cercato di organizzare un rapimento di Jeanne. Jeanne rispose espandendo più libertà religiosa per gli ugonotti. Ha riportato suo figlio in Navarra e gli ha dato un'educazione protestante e militare.
I combattimenti in Navarra e in Francia continuarono. Jeanne si allineò sempre di più agli ugonotti e abbatté la chiesa romana a favore della fede protestante. Un trattato di pace del 1571 tra cattolici e ugonotti portò, nel marzo del 1572, a un matrimonio tra Marguerite Valois, figlia di Caterina de 'Medici e un erede Valois, ed Enrico di Navarra, figlio di Giovanna di Navarra. Jeanne ha richiesto concessioni per il matrimonio, rispettando la sua fedeltà protestante. Morì nel giugno del 1572, prima che potesse avvenire il matrimonio.
Carlo IX fu re di Francia al matrimonio di sua sorella Marguerite con Enrico di Navarra. Catherine de Medici rimase una potente influenza. Il matrimonio ebbe luogo il 18 agosto. Molti ugonotti vennero a Parigi per questo importante matrimonio.
Il 21 agosto, c'è stato un tentativo di omicidio senza successo su Gaspard de Coligny, un leader ugonotto. Durante la notte tra il 23 e il 24 agosto, per ordine di Carlo IX, i militari della Francia uccisero Coligny e altri leader ugonotti. L'omicidio si diffuse attraverso Parigi e da lì in altre città e nel paese. Sono stati macellati da 10.000 a 70.000 ugonotti (le stime variano ampiamente).
Questo omicidio indebolì considerevolmente il partito ugonotto, poiché la maggior parte della sua leadership era stata uccisa. Dei rimanenti ugonotti, molti si sono convertiti alla fede romana. Molti altri si sono induriti nella loro resistenza al cattolicesimo, convinti che fosse una fede pericolosa.
Mentre alcuni cattolici erano inorriditi dal massacro, molti cattolici credevano che le uccisioni avrebbero impedito agli ugonotti di impadronirsi del potere. A Roma si celebravano la sconfitta degli ugonotti, si diceva che Filippo II di Spagna avesse riso quando udì, e si diceva che l'imperatore Massimiliano II fosse inorridito. Diplomatici di paesi protestanti fuggirono da Parigi, tra cui l'ambasciatrice di Elisabetta I d'Inghilterra.
Enrico, duca d'Angiò, era il fratello minore del re, ed era la chiave nello svolgimento del piano di massacro. Il suo ruolo nelle uccisioni ha portato Caterina dei Medici a ritirarsi dalla sua condanna iniziale del crimine, e l'ha anche portata a privarlo del potere.
Enrico d'Angiò successe a suo fratello come re, diventando Enrico III, nel 1574. Le lotte tra cattolici e protestanti, tra cui l'aristocrazia francese, segnarono il suo regno. La "Guerra delle tre galline" mise in conflitto armato Enrico III, Enrico di Navarra e Enrico di Guisa. Enrico di Guisa voleva sopprimere completamente gli ugonotti. Enrico III era per tolleranza limitata. Enrico di Navarra rappresentava gli ugonotti.
Enrico III fece uccidere Enrico I di Guisa e suo fratello Luigi, cardinale, nel 1588, pensando che ciò avrebbe rafforzato il suo dominio. Invece, ha creato più caos. Enrico III riconobbe Enrico di Navarra come suo successore. Quindi un fanatico cattolico, Jacques Clement, assassinò Enrico III nel 1589, credendo che fosse troppo facile con i protestanti.
Quando Enrico di Navarra, il cui matrimonio era stato rovinato dal massacro di San Bartolomeo, succedette a suo cognato come re Enrico IV nel 1593, si convertì al cattolicesimo. Alcuni nobili cattolici, in particolare la Camera di Guise e la Lega cattolica, cercarono di escludere dalla successione chiunque non fosse cattolico. Apparentemente Enrico IV credeva che l'unico modo per portare la pace fosse convertirsi, presumibilmente dicendo: "Parigi merita una messa".
Enrico IV, che era stato un protestante prima di diventare re di Francia, nel 1598 emanò l'Editto di Nantes, concedendo una tolleranza limitata al protestantesimo in Francia. L'Editto conteneva molte disposizioni dettagliate. Uno, per esempio, proteggeva gli ugonotti francesi dall'Inquisizione mentre viaggiavano in altri paesi. Pur proteggendo gli ugonotti, stabilì il cattolicesimo come religione di stato e impose ai protestanti di pagare la decima alla chiesa cattolica, e impose loro di seguire le regole cattoliche del matrimonio e di rispettare le festività cattoliche.
Quando Enrico IV fu assassinato, Marie de Medici, la sua seconda moglie, confermò l'editto entro una settimana, rendendo meno probabile un massacro cattolico di protestanti e riducendo anche la possibilità di ribellione ugonotta.
Nel 1685, il nipote di Enrico IV, Luigi XIV, revocò l'editto di Nantes. I protestanti hanno lasciato la Francia in gran numero e la Francia si è trovata in condizioni peggiori con le nazioni protestanti attorno ad essa.
Conosciuto anche come l'editto di tolleranza, questo fu firmato da Luigi XVI il 7 novembre 1787. Restituì la libertà di adorare i protestanti e ridusse la discriminazione religiosa.
Due anni dopo, la Rivoluzione francese e la Dichiarazione dei diritti dell'uomo e dei cittadini nel 1789 avrebbero portato la completa libertà religiosa.