Una perla naturale è formata da un mollusco - un animale come un'ostrica, una vongola, una conca o un gasteropode.
Le perle si formano quando un irritante, come un po 'di cibo, un granello di sabbia o persino un pezzo del mantello del mollusco, rimane intrappolato nel mollusco. Per proteggersi, il mollusco secerne sostanze che usa anche per costruire il suo guscio: l'aragonite (un minerale) e la conchiolina (una proteina). Queste sostanze sono secrete a strati e si forma una perla.
A seconda di come si forma l'aragonite, la perla può avere un'alta lucentezza (madreperla o madreperla) o una superficie più simile alla porcellana.
Una perla selvaggia ha spesso imperfezioni. Un modo per distinguere una perla naturale da una perla artificiale, secondo l'American Museum of Natural History, è di strofinarla contro i denti. Una perla naturale sembrerà grintosa e una perla artificiale sembrerà liscia.
Le perle create allo stato brado sono rare e costose. Alla fine, le persone hanno iniziato a coltivare le perle, il che comporta l'immissione di un irritante nei gusci dei molluschi. Vengono quindi collocati in cestini e la perla viene raccolta dopo circa 2 anni.
Qualsiasi mollusco può formare una perla, anche se sono più comuni in alcuni animali che in altri. Esistono animali noti come ostriche perlate, che includono specie del genere Pinctada. Le specie Pinctada maxima (chiamato l'ostrica perla dalle labbra d'oro o l'ostrica perla dalle labbra d'argento) vive nell'Oceano Indiano e nel Pacifico dal Giappone all'Australia e produce perle conosciute come South Sea Pearls. Altri animali produttori di perle includono abalones, conchiglie, gusci di penna e bucce. Le perle possono anche essere trovate e coltivate in molluschi d'acqua dolce e sono spesso prodotte da specie collettivamente chiamate "cozze perlate".